Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms