Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD3Q96L08 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD3Q96L08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms