Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms