Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms