Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms