Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APIPQ96GX9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APIPQ96GX9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APIPQ96GX9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APIPQ96GX9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APIPQ96GX9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APIPQ96GX9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APIPQ96GX9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APIPQ96GX9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APIPQ96GX9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APIPQ96GX9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APIPQ96GX9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APIPQ96GX9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APIPQ96GX9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APIPQ96GX9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APIPQ96GX9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APIPQ96GX9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APIPQ96GX9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms