Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGAP3Q96FM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms