Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEIL1Q96FI4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms