Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX11Q96FC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDX11Q96FC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms