Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTERF3Q96E29 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms