Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms