Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC11Q96DB2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms