Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF183Q96D59 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF183Q96D59 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms