Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBGCP3Q96CW5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms