Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF653Q96CK0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms