Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C12orf43Q96C57 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms