Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX58Q96C10 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX58Q96C10 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms