Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VOPP1Q96AW1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms