Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
TRIM52Q96A61 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms