Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTP4Q969X6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UTP4Q969X6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms