Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKL1Q969V6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MKL1Q969V6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms