Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3Q969T4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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