Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF34Q969K3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms