Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms