Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED12Q93074 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED12Q93074 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED12Q93074 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED12Q93074 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED12Q93074 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED12Q93074 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED12Q93074 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED12Q93074 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED12Q93074 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED12Q93074 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED12Q93074 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED12Q93074 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED12Q93074 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED12Q93074 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED12Q93074 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED12Q93074 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED12Q93074 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED12Q93074 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED12Q93074 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED12Q93074 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED12Q93074 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED12Q93074 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED12Q93074 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms