Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PRG4Q92954 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PRG4Q92954 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms