Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEO1Q92859 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms