Protein–RNA interactions for Protein: Q92858

ATOH1, Protein atonal homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH1Q92858 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATOH1Q92858 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATOH1Q92858 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATOH1Q92858 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.2 ms