Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP6NLQ92738 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6NLQ92738 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms