Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms