Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BAP1Q92560 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BAP1Q92560 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BAP1Q92560 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms