Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PALLDQ8WX93 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALLDQ8WX93 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALLDQ8WX93 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms