Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJA4Q8WW22 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms