Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKA2Q8WVK7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms