Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST2Q8WVJ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms