Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DCAF4Q8WV16 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCAF4Q8WV16 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCAF4Q8WV16 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms