Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC7Q8WUI4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms