Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SSH3Q8TE77 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SSH3Q8TE77 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms