Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
RB1CC1Q8TDY2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC43.52■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
RB1CC1Q8TDY2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC43.5■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RB1CC1Q8TDY2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms