Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEK9Q8TD19 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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