Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEDD1Q8NHV4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD1Q8NHV4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms