Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HELBQ8NG08 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms