Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNERQ8NFT8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNERQ8NFT8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms