Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP35Q8NFH5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms