Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF397Q8NF99 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms