Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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