Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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