Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHBP1Q8NDI1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHBP1Q8NDI1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms