Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARRDC4Q8NCT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARRDC4Q8NCT1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARRDC4Q8NCT1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARRDC4Q8NCT1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARRDC4Q8NCT1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARRDC4Q8NCT1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARRDC4Q8NCT1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARRDC4Q8NCT1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25■■□□□ 1.59
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