Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACBD4Q8NC06 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACBD4Q8NC06 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms